โหมด Nightmare ของ Little Nightmare มีทั้งหมด 5 ระดับ ผู้เล่นต้องทราบว่าเมื่อเทียบกับโหมดปกติแล้ว โหมด Nightmare ได้ปรับปรุงความยาวของกระบวนการ ความยากของระดับ และการออกแบบ AI ของศัตรู ดังนั้นจำเป็นต้องมีการเตรียมการที่เพียงพอล่วงหน้า
โหมดฝันร้ายของ Little Nightmares มีทั้งหมด 5 ระดับ
1. ระดับแรก - Lost Forest ในระดับ Lost Forest ผู้เล่นจะต้องค้นหาทางออกและหลบหนีออกจากป่า
2. ระดับที่สอง - ถ้ำลึกลับ ด่านนี้ต้องการให้ผู้เล่นไขปริศนาและค้นหาทางออกไปยังระดับถัดไป
3. ระดับที่สาม - ปราสาทแห่งความมืด ในระดับนี้ ผู้เล่นต้องเผชิญกับปริศนาและศัตรูที่ซับซ้อนต่างๆ
4. ระดับที่สี่ - ความท้าทายขั้นสูงสุด ความท้าทายสูงสุดคือระดับสุดท้ายและท้าทายที่สุดในเกม
5. ระดับที่ห้า - ระดับสุดท้าย การออกแบบของระดับสุดท้ายมักจะรวมองค์ประกอบบางอย่างและความยากของระดับก่อนหน้าทั้งหมดเพื่อให้ผู้เล่นสามารถเผชิญกับความท้าทายขั้นสุดท้ายได้
6. ผู้เล่นต้องทราบว่าเมื่อเปรียบเทียบกับโหมดปกติ โหมด nightmare ได้ปรับปรุงความยาวของกระบวนการ ความยากของระดับ และการออกแบบ AI ของศัตรู ดังนั้นจึงต้องเตรียมการล่วงหน้าอย่างเพียงพอ