openslide

OpenSlide

OpenSlide — это библиотека C для чтения файлов изображений слайдов целиком (также известных как виртуальные слайды). Он предоставляет согласованный и простой API для чтения файлов от разных поставщиков.

Функции

OpenSlide может читать целые изображения слайдов в светлом поле в нескольких форматах:

• Аперио ( .svs , .tif )
• DICOM ( .dcm )
• Хамамацу ( .ndpi , .vms , .vmu )
• Лейка ( .scn )
• МИРАКС ( .mrxs )
• Филипс ( .tiff )
• Сакура ( .svslide )
• Эстакада ( .tif )
• Вентана ( .bif , .tif )
• Цейсс ( .czi )
• Общий мозаичный TIFF ( .tif )

OpenSlide также может предоставлять доступ к профилям ICC, текстовым метаданным и связанным изображениям, таким как метка слайда и миниатюра.

Документация

Справочник по API доступен в Интернете, а также включен в исходный архив как doc/html/openslide_8h.html . Дополнительная документация доступна на веб-сайте OpenSlide.

Лицензия

OpenSlide выпускается на условиях лицензии GNU Lesser General Public License версии 2.1.

OpenSlide распространяется в надежде, что он будет полезен, но БЕЗ КАКИХ-ЛИБО ГАРАНТИЙ; даже без подразумеваемой гарантии ТОВАРНОЙ ПРИГОДНОСТИ или ПРИГОДНОСТИ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕННОЙ ЦЕЛИ. Дополнительную информацию см. в GNU Lesser General Public License.

Компиляция

Для сборки OpenSlide вам понадобится:

• Мезон
• Каир ≥ 1,2
• ГДК-PixBuf
• glib ≥ 2,56
• libdicom ≥ 1.0 (автоматически создается, если отсутствует)
• libjpeg
• libpng
• libtiff ≥ 4,0
• libxml2
• OpenJPEG ≥ 2.1
• SQLite ≥ 3.14
• zlib
• Zстандарт

Затем:

 meson setup builddir
meson compile -C builddir
meson install -C builddir

Благодарности

OpenSlide был разработан Университетом Карнеги-Меллона и другими участниками.

OpenSlide поддерживается Национальными институтами здравоохранения и Институтом клинических и трансляционных наук Питтсбургского университета.

Разработка функциональных возможностей DICOM и ICC поддерживалась NCI Imaging Data Commons и финансировалась полностью или частично за счет федеральных средств Национального института рака и Национальных институтов здравоохранения в соответствии с техническим заданием № HHSN26110071 по контракту № HHSN261201500003l.