この記事では、DCMの医療画像ファイルを解析し、ファイル情報を抽出するJava方法について説明します。次のように、参照のために共有してください。
1。インストール
まず、GitHubに移動してソースコードをダウンロードし、ローカルインストールのためにMVNインストールを実行します。 Maven Centralリポジトリには瓶がありません。 。インストールが成功した後、以下は次のとおりです。
次に、pom.xmlファイルにJARパッケージを紹介します。
<Dependency> groupId> org.dcm4che </groupid> <artifactid> dcm4che-core </artifactid> <バージョン> 3.3.2 </version> </dependency>
2。テストカテゴリ
/** * projectName：xxx * filename：displaytag.java * packagename：com.xxxx.xxxx.common.util *日付：2018-03-26 10:07 *著作権（c）2017-2020 xxx Company */Package com.gz.common.util.wava.wt.image; java.io.file; import java.io.ioexception; Import java.sql.time; Import java.util.arrays; Import java.util.date; Import java.util.logging.level; Import java.util.logging.logger; Import org.dcm4che3.data.attriute; dcm4che3.data.elementdictionary; Import org.dcm4che3.data.fragments; Import org.dcm4che3.data.sequence; import org.dcm4che3.data.tag; Import org.dcm4che3.data.vr; Import org.dcm4che.vr; Import org.dcm4che.io org.dcm4che3.io.dicominputStream; Import org.dcm4che3.io.dicomoutputStream; Import org.dcm4che3.util.safeclose; Import java.awt.image.raster; Import Java.io.ioexception; Import Java.util.util.util. * @classname：displaytag * @packagename：com.xxxx.xxxx.common.util * @description：タグparsing * @data：2018-03-26 10:07 **/public final class displaytag {private static属性obj = null、object = null; Private static diCominputStream DIN; Private static double resultFactordix;プライベート文字列結果= null;プライベートダブル結果2 = null;プライベートストリングnom = null; private string nounstring = null; Private int val2 = 0; Private Int Valeurturn; private string noununit = null; private static double resultfacteurdix = 0;プライベートダブルValuesPatial = null; private string noununitratio = null; private dicominputStream dis; private static final char [] hex_digits = {'0'、 '1'、 '2'、 '3'、 '4'、 '5'、 '6'、 '7'、 '8'、 '' a '、' b '、' c '、' d '、' e '、' f '}; private dicomencodingoptions encopts = dicomencodingoptions.default; private static element -dictionary dict = elementDictionary.getStandardElementDictionary（）; public displaytag（file file）{try {setObject（loaddicomobject（file））; } catch（ioException ex）{logger.getLogger（displaytag.class.getName（））。log（level.severe、null、ex）; }} / ** * DICOM 3.0のメタデータを読む * @param F：入力ファイル * @return属性 * @throws ioexception * / public static属性loaddicomobject（file f）throws ioexception {（f == null）{return null; } else {dicominputStream dis = new dicominputStream（f）; //attr.setspecificcharacterset("gbk "）; dis.readdataset（-1、-1）を返します。 }} / ** * put astibut * @param obj * / public void setObject（astributes obj）{this.obj = obj; } / ** * metadataの属性を与える * @return * / public static属性getobject（）{return obj; } / ** * display metadata * @param file：file inout * @throws ioexception * / public string readtagdicom（file file）throws ioexception {din = new dicominputStream（file）; object = din.readfilemetainformation（）; string value = object.toString（）; object = din.readdataset（-1、-1）;返品値。 } / ** * permet d'afficher l'heure d'une valeur dicom en Standard International yyy.mm.dd /許可表示yyy.mm.dd * @param du tag / intタグyyyy.mm.dd else dd.mm.yyyy * @param valuenoun： "dot" mettre la date en en en format yyyyy.mm.dd ou dd.mm.yyyy sinon en format yyyy mm dd ou dd ou dd mm yyyy/ "dot else yyyy mmまたはdd mm yyyyy * @return afficher le string du tag selon le stardent international/ return string date * @throws ioexception */ public string dicomdate（int、boolean valuebool、string valueNoun）スローIOException string tagdayfomat = formatdate（tagvalue、valuebool、valuenoun）; tagdayfomatを返します。 } else {return null; }}}/ ** * permet d'afficher l'heure d'une valeur dicom en Standard International yyy.mm.dd/許可yyyy.mm.dd * @param Objectのメタデータの時間を表示します。 dd.mm.yyyyy/ if true format yyyy.mm.dd else dd.mm.yyyy * @param valuenoun： "dot" mettre la date en en en en en en en een format yyyy.mm.dd ou dd.mm.yyyy sinon en format yyyy mm dd ou dd mm yyy/ dd dd.mm.ddまたはdd.mm.yyy else yyyy mm or dd mm yyyy * @return le string du tag selon le stander/ return date * @throws ioexception */ public static string dicomdate（属性オブジェクト、intタグ、ブレアン価値= strows strows ioexpring（ tagdayfomat = formatdate（tagvalue、valuebool、valuenoun）; dd.mm.yyyy else in yyyy mm ddまたはdd mm yyyyy *@return */public static string formatdate（string numero、boolean valuebool、string valuenoun）{if（numero.matches（ "^[0-9] *$"））{// stringbuffer（）; if（valuebool == true）{// format yyy.mm.dd for（int i = numero.length（）; i <j; i ++）{r.append（i））; ValueNoun.equals（ '。'）; == null：valuenoun.equals（ "dot"））{r.append（ '。'）; if（valuenoun == null？ "dot" == null：valuenoun.equals（ "dot"）{r.append（ '。'）;インデックスゼロ、インデックス1、およびArray Indexingの場合。 getheaderdatevalue（string tagnr）{return getheaderdatevalue（totagint（tagnr））;ヘッダー番号の表現 * eg 0008,0010への対応する整数への対応する整数として0x00080010 * @see org.dcm4che2.data.tag * @param headernr eg 0008,0010 * @return 0x00080010 as as int */ public static headernr） integer.parseint（headernr.replaceall（ "、"、 ""）、16）; of vr = da * @param tagnr： "0000,0010" * @param dicomobj */ public date getheaderdatevalue（string tagnr、属性dicomobj） TextDicom（string num）{num.ReplaceAll（ "//^+"、 ""）; string tagvalue = arrays.aslist（tagvalue2）.toString（）; string tagvalue = displaytag.arraytostring（tagvalue2、 "//"）; （length> 0）{a [0]）; sの取得時間での時間 *（0008,0032）s画像時間 * @param tag：@return * @throws ioexception */ public string dicomtime（int tag）throws {if（getobject（） formatnotdot（tagvalue）; （0008,0033）@param tag：wide wath ofturn */ public string dicomtimetotal（int tag）throws {getobject（）。 } else {return null;} /** * s sight time at s sigre at at s sight timeでのhh.mm.ss *（0008,0031）の表示時間 *（0008,0032） *（0008,0032） *（0008,0032） *（0008,0033） ioException *dicomtime2（int tag）は、string tagvalue.getString = formatnotdot（tagvalue）をスローします。 / ** * sシリーズ時のsシリーズ時のhh.mm.ss.frac *（0008,0031）でのhh.mm.ss.frac *（0008,0030）の表示時間を許可 * diComtime3（属性、intタグ）はioexception {string tagstring（tag）; getobject（）。getint（tagnr、0）; ** * * @param tagnr eg "0018,0050" <br> *または "0008,0102＃0054,0220" getheaderintegervalue（totagint（tagnr））; cantainsheadertag（int tagnr）{return getobject（）。患者名 */ public string getheadername（string tagnr）{return getheadname（totagint（tagnr））; getobject（tagnr） .Append（ "["）.Append（getVr（tag））。appled（ "]"）。 || getobject（）。{return true} / ** Static Int totagint2（String headernr）{return integer.parseint（ "、"、 ""）、16）; （num.matches（ "^0 * $"）{num = ""; 6; numero.charat（i）&&（i <（j -1））） numero）{numero.matches（ "^[0-9]。*$"））{stringbuilder（） rutch r.toString（）; SetFactorPower（10,2）// 10^2 * @param factor * @return */public static double setfactorpower（double result3、double factor） * @param dcmobj * @return */ public static int [] lattricepixeldata（属性dcmobj）{] data = dcmobj.getints（tag.pixeldata）}/ ** * @return * ioException {int [] data = getobject（tag.pixeldata）; dcmobj.getbytes（tag.pixeldata） Pixeldata * @Param Raster * @return */privatedata（rasterラスター）{raster.getWidth（） int [] [] new int [h] [w]; data2）{data2.int 2 [0] array [h*w];値テーブル入力 * @param患者_additional_tags： * public static final int [] {0x00080020、0x00080022、} Dis.ReadDicomobject（）; ：Patient_additional_tags）{i] = object.getString（tag）; readitem（file inputfile）{displaytag dcm = new displaytag（dcm.getobject（） ATTR.TOSTRING（）; Sequence seq = dc.getobject（）。 RegionDatatype * - PhysicalUnitsXDirection * - PhysicalUnitsXDirection * -PixelComponentPhysicalUnits * * * * * * @Param result */public void unit（int tag、string result）{if（tag == regionspatialformat）{val2 = val2 = integer.valueof setnoununit（「グラフィックス」）またはflow "）; break; case 0：setnoununit（"なしか、該当なし "）; break; default：break;}} else if（tag == tag.regiondatatype）{val2 = integer.valueof（result）.intvalue（）; // convertie en int switch（val2）{case 12：setnoununit（amplitus（amplitus） 11：setnoununit（dt）; setnounit（doppler gean setnunit）。 This.setnounit（該当なし）; trace "）; break; case" d "：this.setnoununit（" gray bar "）; break; case" e "：this.setnoununit（" color bar "）; break; case" f "：this.setnounit（" Integrated Backatter "）; == pixelcomponedphysicalunits）{val2 = integer.intvalue（）; setnounit（cm*setnounit）; setnounit（db/pixel "）。 this.setnounit（cm*cm*pixel/sec "）; setNounUnit("Computed Border"); break; case 8: setNounUnit("Integrated Backscatter"); br eak; case 7: setNounUnit("Color bar"); break; case 6: this.setNounUnit("Gray bar"); break; case 5: this.setNounUnit("Color Flow Intensity"); break; case 4: setNounUnit("Color Flow Variance"); break; case 3: setnounit（case breaking）; classification "）;} elles {this.setnoununit（" none or not not "）;} / ** * enregistrel'intédesアイテム /アイテムの統一 * @param noununit * @return this.noununit = noununit * / public string setnounit; l'intédesitems。 -PixelComponentPhysicalUnits * * @param result: prend l'unite */ public void unitRatioSpatial(int TAG, String result){ if (TAG == Tag.PhysicalUnitsXDirection || TAG == Tag.PhysicalUnitsYDirection || TAG == Tag.PixelComponentPhysicalUnits){ val2= integer.valueof（result）.intvalue（）; // convertie en int switch（val2）{case 9：double valuespatial1 = getValeurtagitemdoubleratio（）* setAgitemdoubleratio（10,1）; setnoununitratio（mm mm.pixel/sec」） 7：setnoununitratio 6： setnoununitratio（mm/pixel）;適用可能 "）; break; default：break;} switch（result）{case" a "：double valuespatial3 = getValeurtagitemdoubleratio（）*setFacteurpuissance（10,2）; setagitemdoubleratio（valuespatial3）; 「B」：getValeurtagitemdoubleratio（）*setagitemdoubleratio（valuespatial4）; }}}/** * PREND LA VALEUR D'UN RATIO SPATIAL/PUT VALUE RATIO SPATIAL * @PARAM VALUESPATIAL */PUBLIC SETTAGITEMDOUBLERATIO（Double ValueSpatial） getValeurtagitemdoubleratio（）{return Valuespatial; ** * donne les valeurs des puissances/ put and computing power * @param result * @return */ public static double setfacturpuissance } / ** * baleur de puissance / giving value power * @return * / public static geteurpuissance（）{return resultfacteurdix; this.noununitratio = noununitratio; des items./giving unityアイテム * @return le nom del'inité */ public string getnoununitratio（）{return noununitratio; }/ ** * prend la valeur interne d'un tag item/ put tag item * @param result * @return */ public string setagitem（string result）{return this.result = result; }/** * donne la valeur du tag rachercher/giving of tag seek * @return le string de la valeur rachercher du tag dans un item */public string getvaleurtagitem（）{return result; }/ ** * prend la valeur interne d'un tag item/ put the value tagitemシャート * @return */ public double setagitemdouble（double result2）{return this.result2 = result2; }/** * donne la valeur du tag rachercher/value the value tag * @return le deol de la valeur rachercher du tag dans un item */public double getvaleurtagitemdouble（）{return result2; } / ** *タグDICOM（DCM4CHE2）から文字列値を読み取ります * @Param Tagnrタグを読む * @return string * as speciound special set special set（0008,0005） *を返します。 elem = getobject（）; ELEM.SETSPECIFICCHARACTERSET（ "GB18030"）;文字列val = elem.getString（tagnr）; if（val == null）{val = ""; } valを返します。 } catch（例外e）{return ""; }} / ** *タグDICOM（dcm4che2）から文字列値を読み取ります * @param tagnrタグを読む * @return stringとして値を読みます *これまたはルートデータセットで定義された特定の文字セット（0008,0005） *を返します。 System.out.println（222）;属性elem = getobject（）; ELEM.SETSPECIFICCHARACTERSET（ "GB18030"）; string [] val = elem.getStrings（tagnr）; valを返します。 } catch（例外E）{nullを返します。 }} / ** * dicomheaderの文字列値を読み取ります * @param tagnrタグを読む * @param dcmelement * @return sing * / public string getheaderstringvalue（属性dcmelement、int tagnr）{try {system.out.out.println（333）; /* dcmelement.setspecificCharacterset（ "ISO_IR 100"）; */ dcmelement.setspecificcharacterset（ "gb18030"）; string val = dcmelement.getString（tagnr）; if（val == null）{val = ""; } valを返します。 } catch（例外e）{return ""; }} / ** *タグ（グループ、要素） * @param headernr eg "0018,0050"を読み取り、スライスの厚さ<br> * @return string * / public string getheaderstringvalue（string headernr）{headernr = headernr.replaceall（ "xx"、 "00"）。 return getheaderstringvalue（totagint（headernr））; } / ** * tag（ "xxxx、"） * @param tagnr * @return * / public time getheadertimevalue（string tagnr）{return getheadertimevalue（totagint（tagnr））; } / ** * tagを与える * @param tagnr * @return time * / public time getheadertimevalue（int tagnr）{string time = getheaderstringvalue（tagnr）; if（time.length（）！= 6）{return null; } try {int hour = integer.parseint（time.substring（0,2））; int min = integer.parseint（time.substring（2,4））; int sec = integer.parseint（time.substring（4,6））;新しい時間（時間、分、秒）を返します。 } catch（例外e）{} nullを返します。 } /** * Anotehrタグ内にある特定のヘッドテルタグ *または "0008,0102、0054,0220"を取得して、コードシーケンスの後にコーディングスキームデザイナーを取得します * @return string * * @param taghierarchy; Eg {tag.uid、tag.sopinstanceuid、tag.codemeneant} * @return */ public string getheadervalueinsidetag（int [] taghierarchy）{try {for（int i = 0; i <taghierarchy.length-1; i ++）{return getobject（）。 }} catch（例外e）{string tags = ""; for（int i = 0; i <taghierarchy.length; i ++）{tags += totagstring（taghierarchy [i]） +""; } 戻る ""; } nullを返します。 } / ** *ヘッダー番号のint表現を変換します * Eg 0x00080010に対応する文字列0008,0010 * @return 0008,0010 As String * / public Static String totagString（int tagnr）{return shorttohex（tagnr >> 16） + '、' + shorthex（tagnr）; } public static string shorttohex（int val）{char [] ch = new char [4]; shorttohex（val、ch、0）;新しい文字列（ch）を返します。 } public static stringbuffer shorttohex（int val、stringbuffer sb）{sb.append（hex_digits [（val >> 12）＆0xf]）; sb.append（hex_digits [（val >> 8）＆0xf]）; sb.append（hex_digits [（val >> 4）＆0xf]）; sb.append（hex_digits [val＆0xf]）; SBを返します。 } public static void shorttohex（int val、char [] ch、int off）{ch [off] = hex_digits [（val >> 12）＆0xf]; ch [off+1] = hex_digits [（val >> 8）＆0xf]; ch [off+2] = hex_digits [（val >> 4）＆0xf]; ch [off+3] = hex_digits [val＆0xf]; } / ** *ファイル出力dicomの作成 * @param fileoutput：file output * @throws ioexception * * * * * * * * * * / public void writeto（file output、属性fmi、属性オブジェクト）Ioexception {dicomoutputStream dos = new dicomoutputtumputtuptuptuptuptuptuptuptuptuptuptup（dicomoutputstream "）をスローするdos.setencodingoptions（encopts）; dos.writedataset（fmi、object）; dos.finish（）; dos.flush（）; } / ** * writting * @param fileoutput * @param h * @param w * @throws ioexception * / public void writeTosegment（file output、int h、int w）throws ioexception {dicomoutputstream dos = new dicomoutputStream（new file（fileoutput +"）; dos.setencodingoptions（encopts）; } / ** * pixeldataでオーバーレイを作成 * @param object * / public void overlaycreate（astributes object）{int position = object.getint（tag.overlaybitposition、0）; if（position == 0）{return; } int bit = 1 << position; int [] pixels = object.getints（tag.pixeldata）; int count = 0; for（int pix：pixels）{int overlay = pix＆bit;ピクセル[count ++] = pix -overlay; } object.setint（tag.pixeldata、vr.ow、pixels）; } /*** dicom.setString（tag.performingphysicianname、vr.pn、 "jean"）; dicom.setString（tag.admittingdiagnosessdescription、vr.lo、 "chu"）;シーケンスseq = dicom.newsequence（tag.AnatomiceRion sequence、0）;属性DICOM2 = new attributes（）; * @param dicom */ public void setItem（属性dicom、int tag sequencename）{sequence seq = dicom.newsequence（tag sequencencename、0）; dicom.setString（tag.codingschemedesignator、vr.sh、 "srt"）; dicom.setString（tag.codevalue、vr.sh、 "t-aa000"）; dicom.setString（tag.codemenean、vr.lo、 "eye"）; seq.add（dicom）; } public static void main（string [] args）スロー例外{file file = new file（ "c：// users // documents // wechat files // fen_do // files // 1234.dcm"）; displaytag d = new displaytag（file）; @suppresswarnings（ "static-access"）属性属性= d.loaddicomobject（file）; //すべての属性情報System.out.println（ "すべて情報：" + attrs）; // get row int row = attrs.getint（tag.rows、1）; //列int columns = attrs.getint（tag.columns、1）を取得します。 //ウィンドウ幅ウィンドウFLOAT WIN_CENTER = ATTRS.GETFLOAT（Tag.WindowCenter、1）; float win_width = attrs.getFloat(Tag.WindowWidth, 1); System.out.println("" + "row=" + row + ",columns=" + row + ",row*columns = " + row * columns); String patientName = attrs.getString(Tag.PatientName, ""); System.out.println("姓名：" + patientName); //生日String patientBirthDate = attrs.getString(Tag.PatientBirthDate, ""); System.out.println("生日：" + patientBirthDate); //机构String institution = attrs.getString(Tag.InstitutionName, ""); System.out.println("机构：" + institution); //站点String station = attrs.getString(Tag.StationName, ""); System.out.println("站点：" + station); //制造商String Manufacturer = attrs.getString(Tag.Manufacturer, ""); System.out.println("制造商：" + Manufacturer); //制造商模型String ManufacturerModelName = attrs.getString(Tag.ManufacturerModelName, ""); System.out.println("制造商模型：" + ManufacturerModelName); //描述--心房String description = attrs.getString(Tag.StudyDescription, ""); System.out.println("描述--心房：" + description); //描述--具体String SeriesDescription = attrs.getString(Tag.SeriesDescription, ""); System.out.println("描述--具体：" + SeriesDescription); //描述时间String studyData = attrs.getString(Tag.StudyDate, ""); System.out.println("描述时间：" + studyData); byte[] bytename = attrs.getBytes(Tag.PatientName); System.out.println("姓名: " + new String(bytename,"gb18030")); byte[] bytesex = attrs.getBytes(Tag.PatientSex); System.out.println("性别: " + new String(bytesex,"gb18030")); }}输出如下:
所有信息: (0008,0005) CS [ISO_IR 100] SpecificCharacterSet
(0008,0008) CS [ORIGINAL/PRIMARY] ImageType
(0008,0016) UI [1.2.840.10008.5.1.4.1.1.1.1] SOPClassUID
(0008,0018) UI [1.2.840.113619.2.203.4.2147483647.1486521160.448521] SOPInstan
(0008,0020) DA [20170208] StudyDate
(0008,0021) DA [20170208] SeriesDate
(0008,0022) DA [20170208] AcquisitionDate
(0008,0023) DA [20170208] ContentDate
(0008,002A) DT [20170208103237.000000] AcquisitionDateTime
(0008,0030) TM [103154.000] StudyTime
(0008,0031) TM [103158.000] SeriesTime
(0008,0032) TM [103237.000] AcquisitionTime
(0008,0033) TM [103240.000] ContentTime
(0008,0050) SH [T77792] AccessionNumber
(0008,0060) CS [DX] Modality
(0008,0068) CS [FOR PRESENTATION] PresentationIntentType
(0008,0070) LO ["GE Healthcare"] Manufacturer
(0008,0080) LO [HeFei RICH] InstitutionName
(0008,0081) ST [Not Initialized
Not Initialized
HeFei
AnHui
Not Initialize(0008,0090) PN [] ReferringPhysicianName
(0008,1010) SH [082407110134] StationName
(0008,1030) LO [ACHEST] StudyDescription
(0008,103E) LO [Chest] SeriesDescription
(0008,1040) LO [Not Initialized] InstitutionalDepartmentName
(0008,1050) PN [] PerformingPhysicianName
(0008,1090) LO ["Definium 6000"] ManufacturerModelName
(0008,1110) SQ [] ReferencedStudySequence
(0008,1120) SQ [] ReferencedPatientSequence
(0008,2112) SQ [1 Items] SourceImageSequence
>Item #1
>(0008,1150) UI [1.2.840.10008.5.1.4.1.1.1.1.1] ReferencedSOPClassUID
>(0008,1155) UI [1.2.840.113619.2.203.4.2147483647.1486521157.927189] Referenc
(0008,2218) SQ [1 Items] AnatomicRegionSequence
>Item #1
>(0008,0100) SH [T-D3000] CodeValue
>(0008,0102) SH [SNM3] CodingSchemeDesignator
>(0008,0104) LO [Chest] CodeMeaning
(0010,0010) PN [zhang^xiao di] PatientName
(0010,0020) LO [T77792] PatientID
(0010,0030) DA [19860618] PatientBirthDate
(0010,0032) TM [] PatientBirthTime
(0010,0040) CS [F] PatientSex
(0010,1010) AS [030Y] PatientAge
(0010,1030) DS [] PatientWeight
(0011,0010) LO [GEMS_GDXE_FALCON_04]
(0011,1003) UI [1.2.840.113619.2.203.4.2147483647.1486521118.562807]
(0011,1004) CS [SE]
(0011,1005) UI [1.2.840.113619.2.203.4.2147483647.1486521152.970120]
(0011,1006) DS [0.083936]
(0011,1009) SL [0]
...
row=2021,columns=2021,row*columns = 4084441
姓名：zhang^xiao di
生日：19860618
机构：HeFei RICH
站点：082407110134
制造商："GE Healthcare"
制造商模型："Definium 6000"
描述--心房：ACHEST
描述--具体：Chest
描述时间：20170208
姓名: zhang^xiao di
性别: F
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