ViMO

Vimo

Visualizer for MetaAmics (VIMO) es una aplicación interactiva basada en R-shiny para facilitar la integración de datos entre metagenómica, metatranscriptómica y metaproteómica. Al mismo tiempo, VIMO tiene como objetivo proporcionar al usuario representaciones gráficas interactivas, listas para la publicación y relevantes de los datos.

Se puede acceder a VIMO en línea aquí:
https://magnusarntzen.shinyapps.io/visualizerformetaomics/

Vimo Integre datos de

• Metagenómica
• Metatranscriptómica
• Metaproteómica
• Taxonomía
• Medidas de calidad
• Funciones de Kegg y finalización del módulo
• Enzimas activas de carbohidratos (cazimas)

Vimo hace tramas de:

• Calidad de la revista
• Abundancia de mag en varios archivos
• Categorías de cazyme en varias revistas y sus abundaciones a nivel de transcripción y proteína
• Categorías de KEGG en varias revistas y sus abundaciones a nivel de transcripción y proteína
• Fracciones de finalización del módulo KEGG para ver el potencial metabólico para cada mag

Alguna salida de ejemplo:

Informes de errores

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