مجموعات بيانات طبية و VQA الطبية
إجابة أسئلة متعددة الوسائط (QA) في المجال الطبي: ملخص لمجموعات البيانات والأنظمة الحالية
لقد قمت بإعداد هذا الملخص لمتحدث CMU/LTI على QA متعدد الوسائط. شرائح بلدي متوفرة على https://www.slideshare.net/benabacha/multimodal-question-ancewering-in-the-medical-domain-cmulti-2020
هذه القائمة ليست شاملة. يمكنك مراسلتي عبر البريد الإلكتروني روابط ومراجع لمجموعات بيانات وأنظمة ضمان الجودة الطبية ذات الصلة وسأقوم بتحديث القائمة في أسرع وقت ممكن. أيضًا ، لم تعد مجموعات البيانات المتعلقة بالتحدي متاحة للجمهور بعد الآن. يمكنك الاتصال بالمنظمين للحصول على البيانات.
*** مهامتان رئيسيتان: إجابة أسئلة طبية (QA) والإجابة على الأسئلة المرئية (VQA) ***
ط) مجموعات بيانات ضمان الجودة الطبية:
- كوربوس لتلخيص الطب القائم على الأدلة (مولا ، 2010): https://sourceforge.net/projects/ebmsumcorpus
- CLEF QA4MRE TASTENT ALZHEIMER (Peñas et al ، 2012).
- مجموعات بيانات Bioask (2012-2020): http://bioasq.org/partisterate/challenges
- TREC LIVEQA-MED (Ben Abacha et al ، 2017): https://github.com/abachaa/liveqa_medicaltask_trec2017
- Mediqa-2019 مجموعات بيانات على NLI و RQE و QA (Ben Abacha et al. ، 2019): https://github.com/abachaa/mediqa2019
- مجموعة بيانات Mediqa-ans من الإجابات التي تعتمد على الأسئلة (Savery et al. ، 2020): https://osf.io/fyg46/ paper: https://www.nature.com/articles/S41597-020-00667-z
- مجموعة Medquad من 47K QA Bairs (Ben Abacha and Demner-Fushman ، 2019): https://github.com/abachaa/medquad
- مجموعة QA الدواء (Ben Abacha et al. ، 2019): https://github.com/abachaa/medication_qa_medinfo2019
- تلخيص سؤال صحة المستهلك (بن أباشا ودينر فوشمان ، 2019): https://github.com/abachaa/meqsum
- EMRQA: QA على السجلات الطبية الإلكترونية (Pampari et al. ، 2018). البرامج النصية لإنشاء EMRQA من بيانات I2B2: https://github.com/panushri25/emrqa
- مجموعة بيانات Epic-QA على Covid-19 (Goodwin et al. ، 2020): https://bionlp.nlm.nih.gov/epic_qa/
- Biqa Corpus (Lamurias et al. ، 2020): https://github.com/lasigebiotm/biqa paper: https: //ieeexplore.ieee.org/document/9184044
- مجموعة بيانات HealthQa (Zhu et al. ، 2019): https://github.com/mingzhu0527/har paper: https://dmkd.cs.vt.edu/papers/www19.pdf
- مجموعة بيانات MASH-QA على إجابة متعددة تمتد على إجابة الأسئلة على الرعاية الصحية ، مع 35 ألف أزواج QA (Zhu et al. ، 2020): https://github.com/mingzhu0527/mashqa ورقة: https://www.aclweb.org/anthology
- Medmcqa: مجموعة بيانات متعددة الخيارات على نطاق واسع من أجل إجابة أسئلة المجال الطبي. (Pal et al. ، chil ، PMLR 2022): https://github.com/medmcqa/medmcqa paper: https://procedings.mlr.press/v174/pal22a.html
2) مجموعات بيانات VQA الطبية (الأشعة):
- VQA-Rad (Lau et al. 2018): https://osf.io/89kps
- VQA-MED 2018 (Hasan et al. 2018): https://www.aicrowd.com/challenges/imageclef-2018-vqa-med
- VQA-MED 2019 (Ben Abacha et al. 2019): https://github.com/abachaa/vqa-med-2019
- VQA-MED 2020 (Ben Abacha et al. 2020): https://github.com/abachaa/vqa-med-2020
3) أنظمة ضمان الجودة عبر الإنترنت:
- لقد بحثت واختبرت العديد من الأنظمة (على سبيل المثال Askhermes ، Mipacq ، SIMQ). تتضمن هذه القائمة فقط الأنظمة التي لا تزال محفوظة.
- chiqa (نظام الإجابة على أسئلة صحة المستهلك): chiqa.nlm.nih.gov
- Neural Covidex: Covidex.ai
4) مجموعات البيانات الطبية ذات الصلة بالإجابة على الأسئلة:
- المهام المشتركة I2B2 (2006-2016): www.i2b2.org/nlp
- N2C2 NLP التحديات السريرية (2018-2019): https://n2c2.dbmi.hms.harvard.edu https://dbmi.hms.harvard.edu/programs
- TREC Medical Records Track (2012-2013).
- مسار دعم القرار السريري TREC (2014-2016): http://www.trec-cds.org
- TREC Precision Medicine Track (2017-2019): http://www.trec-cds.org
- clef eHealth (2013-2020): https://clefehealth.imag.fr
- Covid Dataset (Cord-19): https://www.kaggle.com/allen-institute-for-ai/cord-19-research-challenge
5) مجموعات البيانات الطبية ذات الصلة بـ VQA:
- include ImageClef Medical Automatic Image Eanotation (2008-2009): https://www.imageclef.org/2008/medaat and https://www.imageclef.org/2009/medanno
- ImageClef Medical Turvied-Or-Orgended Retrieval Task (2011): https://www.imageclef.org/2011/medicaluseroriented
- مهمة استرجاع ImageClef Medical (2008-2012): https://www.imageclef.org/2012/medical
- ImageClef Amia: المهمة الطبية (2013): https://www.imageclef.org/2013/medical
- ImageClefmed: التصنيف الطبي (2015): https://www.imageclef.org/2015/medical
- ImageClef Medical Clustering (2015): https://www.imageclef.org/2015/clustering
- ImageClefmed (2016): https://www.imageclef.org/2016/medical
- ImageClefCaption (2017-2020): https://www.imageclef.org/2017/caption
- مهام ImageClefmedical (2019-2020): https://www.imageclef.org/2019/medical and https://www.imageclef.org/2020/medical
- Mimic-CXR Database (2019): https://physionet.org/content/mimic-cxr/2.0.0/
اتصال
- Asma Ben abacha (abenabacha at microsoft dot com)